Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mfsd13aQ6PDE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd13aQ6PDE8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms