Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rundc3bQ6PDC0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc3bQ6PDC0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3bQ6PDC0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms