Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcf1Q6P542 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf1Q6P542 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf1Q6P542 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf1Q6P542 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf1Q6P542 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf1Q6P542 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf1Q6P542 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf1Q6P542 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf1Q6P542 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf1Q6P542 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcf1Q6P542 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abcf1Q6P542 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcf1Q6P542 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcf1Q6P542 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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