Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retreg2Q6NS82 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retreg2Q6NS82 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retreg2Q6NS82 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retreg2Q6NS82 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms