Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lcn12Q6JVL5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lcn12Q6JVL5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lcn12Q6JVL5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lcn12Q6JVL5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lcn12Q6JVL5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lcn12Q6JVL5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lcn12Q6JVL5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lcn12Q6JVL5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lcn12Q6JVL5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms