Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3rf1Q69ZI1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Sh3rf1Q69ZI1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Sh3rf1Q69ZI1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3rf1Q69ZI1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3rf1Q69ZI1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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