Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ino80dQ66JY2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ino80dQ66JY2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms