Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim24Q64127 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim24Q64127 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim24Q64127 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim24Q64127 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms