Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3bQ62177 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3bQ62177 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3bQ62177 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3bQ62177 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3bQ62177 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sema3bQ62177 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3bQ62177 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3bQ62177 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3bQ62177 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3bQ62177 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3bQ62177 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3bQ62177 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3bQ62177 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema3bQ62177 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema3bQ62177 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema3bQ62177 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema3bQ62177 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema3bQ62177 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema3bQ62177 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms