Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp3Q61810 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ltbp3Q61810 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ltbp3Q61810 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltbp3Q61810 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ltbp3Q61810 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ltbp3Q61810 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp3Q61810 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltbp3Q61810 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltbp3Q61810 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms