Protein–RNA interactions for Protein: Q61753

Phgdh, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhgdhQ61753 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PhgdhQ61753 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PhgdhQ61753 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PhgdhQ61753 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PhgdhQ61753 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms