Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HlxQ61670 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HlxQ61670 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HlxQ61670 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HlxQ61670 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HlxQ61670 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HlxQ61670 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HlxQ61670 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HlxQ61670 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HlxQ61670 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HlxQ61670 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HlxQ61670 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HlxQ61670 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HlxQ61670 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HlxQ61670 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HlxQ61670 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms