Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vsx2Q61412 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsx2Q61412 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsx2Q61412 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms