Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin1Q60865 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin1Q60865 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caprin1Q60865 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin1Q60865 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 380.8 ms