Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Klf4Q60793 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klf4Q60793 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Klf4Q60793 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klf4Q60793 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf4Q60793 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf4Q60793 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf4Q60793 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf4Q60793 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klf4Q60793 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klf4Q60793 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf4Q60793 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf4Q60793 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf4Q60793 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klf4Q60793 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klf4Q60793 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf4Q60793 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klf4Q60793 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Klf4Q60793 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klf4Q60793 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klf4Q60793 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klf4Q60793 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf4Q60793 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf4Q60793 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms