Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb6Q60692 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb6Q60692 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms