Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms