Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsr1Q5SWD9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsr1Q5SWD9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tsr1Q5SWD9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsr1Q5SWD9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms