Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufaf2Q59J78 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufaf2Q59J78 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndufaf2Q59J78 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufaf2Q59J78 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufaf2Q59J78 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf2Q59J78 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms