Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Eme2Q56A04 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Eme2Q56A04 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Eme2Q56A04 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eme2Q56A04 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms