Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1orf109Q499E6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
C1orf109Q499E6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1orf109Q499E6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf109Q499E6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C1orf109Q499E6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C1orf109Q499E6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf109Q499E6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf109Q499E6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C1orf109Q499E6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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