Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2al1nQ497L1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1nQ497L1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms