Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp48Q3V0C5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp48Q3V0C5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp48Q3V0C5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp48Q3V0C5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp48Q3V0C5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 422.3 ms