Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hipk4Q3V016 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hipk4Q3V016 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hipk4Q3V016 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms