Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E330034G19RikQ3UWX6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E330034G19RikQ3UWX6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms