Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca4bQ3UW98 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clca4bQ3UW98 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clca4bQ3UW98 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Clca4bQ3UW98 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clca4bQ3UW98 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca4bQ3UW98 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clca4bQ3UW98 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca4bQ3UW98 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.7 ms