Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BB287469Q3UT53 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BB287469Q3UT53 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms