Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc34Q3UI66 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc34Q3UI66 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc34Q3UI66 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms