Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc177Q3UHB8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc177Q3UHB8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms