Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem109Q3UBX0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem109Q3UBX0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem109Q3UBX0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem109Q3UBX0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms