Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf149Q3U2C5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf149Q3U2C5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf149Q3U2C5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf149Q3U2C5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf149Q3U2C5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf149Q3U2C5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf149Q3U2C5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf149Q3U2C5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms