Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LcorlQ3U285 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LcorlQ3U285 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LcorlQ3U285 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LcorlQ3U285 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms