Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTH7

1500011B03Rik, RIKEN cDNA 1500011B03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500011B03RikQ3TTH7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1500011B03RikQ3TTH7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms