Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim43aQ3TL54 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim43aQ3TL54 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim43aQ3TL54 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim43aQ3TL54 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms