Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc13Q3TIR1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc13Q3TIR1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms