Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul4aQ3TCH7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4aQ3TCH7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul4aQ3TCH7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms