Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA38

Tmem120b, Transmembrane protein 120B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem120bQ3TA38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem120bQ3TA38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem120bQ3TA38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem120bQ3TA38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem120bQ3TA38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem120bQ3TA38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem120bQ3TA38 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem120bQ3TA38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem120bQ3TA38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmem120bQ3TA38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem120bQ3TA38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem120bQ3TA38 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem120bQ3TA38 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms