Protein–RNA interactions for Protein: Q208S0

Teddm2, Epididymal protein Me9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm2Q208S0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Teddm2Q208S0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Teddm2Q208S0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Teddm2Q208S0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms