Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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