Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tigd2Q0VBL1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd2Q0VBL1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tigd2Q0VBL1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tigd2Q0VBL1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms