Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf9Q07105 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdf9Q07105 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gdf9Q07105 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms