Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Siah2Q06986 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah2Q06986 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms