Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnd1Q03719 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnd1Q03719 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnd1Q03719 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnd1Q03719 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnd1Q03719 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnd1Q03719 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnd1Q03719 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms