Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Thbs2Q03350 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms