Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htr1fQ02284 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Htr1fQ02284 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htr1fQ02284 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Htr1fQ02284 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms