Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IhhP97812 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IhhP97812 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IhhP97812 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IhhP97812 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IhhP97812 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IhhP97812 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IhhP97812 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IhhP97812 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IhhP97812 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IhhP97812 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IhhP97812 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IhhP97812 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IhhP97812 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IhhP97812 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IhhP97812 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IhhP97812 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IhhP97812 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IhhP97812 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IhhP97812 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IhhP97812 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IhhP97812 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IhhP97812 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IhhP97812 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IhhP97812 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IhhP97812 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IhhP97812 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IhhP97812 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IhhP97812 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IhhP97812 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IhhP97812 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IhhP97812 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IhhP97812 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IhhP97812 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IhhP97812 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IhhP97812 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IhhP97812 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IhhP97812 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IhhP97812 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IhhP97812 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IhhP97812 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IhhP97812 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IhhP97812 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IhhP97812 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IhhP97812 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IhhP97812 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IhhP97812 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IhhP97812 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IhhP97812 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IhhP97812 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IhhP97812 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IhhP97812 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IhhP97812 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IhhP97812 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IhhP97812 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IhhP97812 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IhhP97812 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IhhP97812 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IhhP97812 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IhhP97812 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IhhP97812 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IhhP97812 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IhhP97812 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IhhP97812 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IhhP97812 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IhhP97812 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IhhP97812 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IhhP97812 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IhhP97812 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IhhP97812 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IhhP97812 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IhhP97812 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IhhP97812 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IhhP97812 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IhhP97812 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IhhP97812 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IhhP97812 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IhhP97812 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IhhP97812 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IhhP97812 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IhhP97812 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IhhP97812 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IhhP97812 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IhhP97812 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IhhP97812 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IhhP97812 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IhhP97812 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IhhP97812 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IhhP97812 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IhhP97812 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IhhP97812 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IhhP97812 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IhhP97812 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IhhP97812 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IhhP97812 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IhhP97812 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IhhP97812 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IhhP97812 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IhhP97812 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IhhP97812 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.6 ms