Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig3P97386 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lig3P97386 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lig3P97386 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lig3P97386 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lig3P97386 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lig3P97386 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig3P97386 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig3P97386 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig3P97386 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lig3P97386 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig3P97386 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig3P97386 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig3P97386 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig3P97386 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig3P97386 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig3P97386 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms