Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meis3P97368 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Meis3P97368 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Meis3P97368 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis3P97368 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Meis3P97368 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Meis3P97368 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis3P97368 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis3P97368 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Meis3P97368 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis3P97368 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Meis3P97368 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms