Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmsP97355 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmsP97355 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmsP97355 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmsP97355 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmsP97355 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmsP97355 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmsP97355 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SmsP97355 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmsP97355 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmsP97355 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmsP97355 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmsP97355 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmsP97355 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmsP97355 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmsP97355 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmsP97355 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SmsP97355 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmsP97355 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmsP97355 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmsP97355 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmsP97355 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmsP97355 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmsP97355 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmsP97355 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmsP97355 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmsP97355 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmsP97355 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmsP97355 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmsP97355 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmsP97355 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmsP97355 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmsP97355 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmsP97355 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmsP97355 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmsP97355 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmsP97355 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SmsP97355 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SmsP97355 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SmsP97355 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SmsP97355 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SmsP97355 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SmsP97355 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmsP97355 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmsP97355 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmsP97355 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmsP97355 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmsP97355 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SmsP97355 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SmsP97355 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SmsP97355 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SmsP97355 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SmsP97355 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SmsP97355 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SmsP97355 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SmsP97355 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SmsP97355 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SmsP97355 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SmsP97355 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SmsP97355 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SmsP97355 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SmsP97355 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SmsP97355 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SmsP97355 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SmsP97355 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SmsP97355 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SmsP97355 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SmsP97355 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SmsP97355 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SmsP97355 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmsP97355 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmsP97355 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmsP97355 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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SmsP97355 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SmsP97355 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SmsP97355 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SmsP97355 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SmsP97355 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SmsP97355 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SmsP97355 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SmsP97355 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SmsP97355 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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SmsP97355 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SmsP97355 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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SmsP97355 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmsP97355 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmsP97355 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmsP97355 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmsP97355 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmsP97355 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmsP97355 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SmsP97355 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmsP97355 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SmsP97355 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmsP97355 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SmsP97355 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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