Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rps3aP97351 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3aP97351 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps3aP97351 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3aP97351 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms